Sementara itu di bidang perhubungan udara, Pemerintah Daerah sedang berupaya untuk menyelesaikan pembangunan bandara Botawa. Apabila pembangunannya telah rampung, maka akses lewat udara dapat lebih cepat dan murah dijangkau melalui bandar udara botawa.
Panjang Runway bandara yang dibangun adalah 650 meter. Dananya Rp 13 Miliar, pada tahun 2012 disiapkan Rp 9 Miliar, sementara bantuan dari APBD Provinsi sebesar Rp 9 Miliar.” Kita sangat bersyukur kepada masyarakat Botawa mereka tidak meminta ganti rugi tanah,”kata Bupati Kabupaten Waropen,Dr.Yesaya Buiney.
Untuk melayani masyarakat di Distrik yang jauh, Pemerintah Kabupaten Waropen di tahun anggaran 2013 ini telah melakukan penandatangan MoU bersama pihak Susy Air dalam memberikan subsidi penerbangan pesawat perintis kepada masyarakat Waropen khususnya dari Kabupaten Nabire ke Distrik Kirihi, sambil menunggu penyelesaian pembangunan bandara botawa.